Ее архитектура относится к типу храмов-городков, соединяющих несколько объемов. Деньги на строительство дали богатейше купцы того времени - братья Скрипины. Они были одарены патриархом Иосифом частицей ризы Господней, которая хранилась в Успенском соборе Московского кремля. В честь получения святыни был сооружён шатровый Ризоположенский придел. Росписи сделали знаменитые костромские художники Гурий Никитин и Сила Савин в 1680 году. В конце 18-го века Илья стал центром радиально-кольцевой планировки городского посада, вокруг образовалась Ильинская площадь. Был храм и антирелигиозным музеем в советское время. В 1989 Илью вновь освятили для совместного пользования музеем-заповедником и церковью.